给出的理由很是冠冕堂皇：“查得祖宗朝故事，宣宗以宣德三年立，英宗为皇太子时年二岁，宪宗以成化十一年立，孝宗为皇太子时年六岁，孝宗以弘治五年立武宗为皇太子，尚未周岁也。盖冢岁升储，所以明震器之重；冲年贻哲，所以端蒙养之功。成宪具存，昭然可考。”
单从表面上来看，申时行的理由完全是为了大明的江山社稷考虑，但是要结合当时的具体情况来看，则不难发现申时行册立皇太子的请求完全就是无理取闹。
前文多次说过，明代册立皇太子施行的是“有嫡立嫡，无嫡立长”的嫡长制，并不是顺位继承制。故朱常洛虽然是明神宗的皇长子，但却不是嫡长子，并且当时的明神宗和皇后均不过二十一二岁，谁能保证嫡长子不会降生？如果此时贸然册立朱常洛为皇太子，那么等到嫡长子降生后再改立皇太子不是更麻烦？
以上情况在这一世基本没变，因此事情一出，还不等皇帝烦恼，高务实就给出了解决办法：就说要等嫡长子出生。皇帝照办了，因此安生了好几年没人再提起。
在原历史中也差不多，虽然没有高务实献策，但朱翊钧也是这样驳回的。然而接下来，申时行虽然没有再次上疏，但是文官集团中的其他人却不干了。例如户科给事中姜应麟、吏部主事孙如法等人，又相继上疏请求册立朱常洛为皇太子。
文官集团中的任何一个人都不可能不知道嫡长制是什么，以及册立朱常洛为皇太子可能会遇到的麻烦，但是却没有人站出来明确反对册立朱常洛为皇太子。据此可知，申时行、姜应麟、孙如法等人代表的其实就是文官集团的态度。
所以，国本之争最初阶段的本质完全就是文官集团在无理取闹——先别急，不要忙于下结论说文官集团吃饱了没事干才会无理取闹，且看后来。
万历二十年，文官集团仍然没有等到皇后有孕的消息，以礼科给事中李献可、吏科给事中钟羽正上疏，请求让朱常洛出阁读书为标志，国本之争风云再起。
国本之争至此已经持续了六年，而文官集团仍然众口一词的要求册立朱常洛为皇太子，这是极为反常的。要知道唐武宗时，李党占据绝对优势的情况下也无法在朝廷上统一口径，所以，朱翊钧此时终于明白文官集团的众口一词一定是有幕后黑手在协调。
明白了这一点后，无论朱翊钧想不想册立朱常洛为皇太子，他都不可能在此时册立朱常洛为皇太子了，因为这样做就会正中文官集团及其幕后黑手的下怀——即一日不册立朱常洛为皇太子，就意
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